【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
查看: 1133  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者三叶虫的脚印将赠送您 8 个金币

三叶虫的脚印

新虫 (初入文坛)

[求助] 如果想要用4*4*4个q点计算一个四方晶系的声子谱,q点应该怎么设?已有1人参与

如果想要用4*4*4个q点计算一个四方晶系的声子谱,q点应该怎么设?还有提示中的问题和虚频问题

输入qua-relax.in
#Number of data sets
ndtset 2
#Dataset1:Initial self-consistent run
getwfk1 0             # Cancel default
kptopt1 1             #for the ground state
iscf1 7               #Self-consistent calculation, using algorithm 7
tolvrs1 1.0d-18       #SCF stopping criterion
#Dataset2:Response-function calculation, with q=0
getwfk2 -1            #Use GS wave functions from dataset1
kptopt2 2             #for response functions at q=0
iscf2 7               #Self-consistent calculation, using algorithm 5
rfphon2 1             #Will consider phonon-type perturbation
rfatpol2 1 6          #All the atoms will be displaced
rfdir2 1 1 1          #Along all reduced coordinate axis
nqpt2 1               #One wavevector is to be considered
ngqpt 4 4 4
tolvrs2 1.0d-22       #SCF stopping criterion
#Common input variables
acell      7.2673047890E+00  7.2673047890E+00  4.6380985420E+00
angdeg 90 90 90
ntypat 2
znucl 14 8
natom 6
typat 2*1 4*2
             xred      0.0000000000E+00  0.0000000000E+00  0.0000000000E+00
                       5.0000000000E-01  5.0000000000E-01  5.0000000000E-01
                       2.9967303949E-01  2.9967303949E-01  1.3729447097E-18
                       2.0032696051E-01  7.9967303949E-01  5.0000000000E-01
                       7.0032696051E-01  7.0032696051E-01 -1.3729447097E-18
                       7.9967303949E-01  2.0032696051E-01  5.0000000000E-01
ecut 80
ngkpt 10 10 10
nshiftk 1
shiftk 0.5 0.5 0.5
nstep 100
#bands and occupation
tsmear 0.02
#
kptopt 1
diemac 12.0
ixc 1
optforces 1
chksymbreak 0

log文件中的提示:
--- !WARNING
src_file: distrb2.F90
src_line: 113
message: |
    nkpt*nsppol (75) is not a multiple of nproc_kpt (24)
    The k-point parallelisation is not efficient.
...
--- !WARNING
src_file: mpi_setup.F90
src_line: 622
message: |
    Your number of spins*k-points (=75) will not distribute correctly
    with the current number of processors (=24).
    You will leave some empty.
    YOU ARE STRONGLY ADVICED TO ACTIVATE AUTOMATIC PARALLELIZATION!
    PUT "AUTOPARAL=1" IN THE INPUT FILE.
...
--- !WARNING
src_file: m_hdr.F90
src_line: 3980
message: |
    input nkpt=500 not equal disk file nkpt=75
...
--- !WARNING
src_file: m_hdr.F90
src_line: 4214
message: |
    input kptopt= 2  /= disk file kptopt= 1
...

--- !WARNING
src_file: m_hdr.F90
src_line: 4509
message: |
    Restart of self-consistent calculation need translated wavefunctions.
...

out文件中的虚频。。
Phonon frequencies in cm-1    :
- -1.704008E+02  1.012839E+01  1.398780E+01  1.398780E+01  4.443393E+02
-  5.406203E+02  5.406203E+02  7.389403E+02  7.902434E+02  7.902434E+02
-  8.843817E+02  8.843817E+02  9.283579E+02  1.058092E+03  1.066444E+03
-  1.180454E+03  1.180454E+03  1.298081E+03

小女子不才,初学ABINIT,望各路大牛海涵~
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

呃~现在可以直接用nqpt了么?记得以前老版本时的套路是先在kptopt = 1,nshiftk = 1,shiftk = (0,0,0)的情况下跑一个简单的scf,通过ngkpt得到q-mesh。
然后,再在计算声子的输入文件中,按照上一个计算中k点的量来设置ndtset,然后每个k点在本输入文件中为qpt,每个qpt是一个单独的声子计算……
另外,不排除一些计算在运用asr之前有小的虚频,所以还是需要anaddb处理之后看图中是否存在虚频,不过-170cm^(-1)的虚频倒是不小……
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2016-12-22 23:47:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Maple_autumn

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

首先,有个基本的问题,你在用格点法取k点和q点的时候,怎么能取ngkpt 10 10 10,ngqpt 4 4 4呢?这样的话,在你取得声子的格点上你计算电子了吗?ngqpt的参数需要能整除ngkpt。第二,acell三个值不相等,格点怎么能取10 10 10,4 4 4了?第三,rf计算能用iscf=7吗?第四,声子计算的时候似乎应该考虑参数nline?这个我也不是很清楚。至于报错似乎是个并行运算问题,不过你先把上面的问题改好试试?楼上说的方法在现在的版本也能用来作为参考的。
3楼2017-03-05 17:25:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 三叶虫的脚印 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 申请省自然科学基金,研究区能否是省外区域 100+3 喜欢兔兔的我 2024-04-15 13/650 2024-04-19 21:49 by 喜欢兔兔的我
[找工作] 事业单位还是大学好? +17 青萍之沫 2024-04-16 18/900 2024-04-19 17:45 by charles-c
[考博] 山东大学化学与化工学院刘磊课题组博士研究生招生启事 +3 sdorganic 2024-04-17 5/250 2024-04-19 17:04 by 368ghnf
[教师之家] 美国教授开除中国研究生:我就不该录取你! +7 苏东坡二世 2024-04-15 7/350 2024-04-19 16:20 by feng6531
[考博] 25申博记录贴 +3 我属驴核动力驴 2024-04-18 4/200 2024-04-19 10:53 by 安塔瓦拉多
[基金申请] 国家资助博士后BC档出校后资助的概率多大? +3 卡卡罗特哦 2024-04-16 3/150 2024-04-18 12:58 by wolfgangHugh
[考研] 0854计算机技术316分调剂,求求导师 捞我一下,有学就上 +6 zhushijie218 2024-04-16 7/350 2024-04-17 23:33 by petro
[考研] 275求调剂 +8 调剂0856 2024-04-14 10/500 2024-04-17 23:23 by 华北刘兵
[无机/物化] H3PO2在130度附近分解为磷化氢(剧毒),怎样防护,求指点。 1(金币+5) +3 大力2010 2024-04-13 9/450 2024-04-17 21:55 by 大力2010
[考研] 工学322,英语六级求调剂 +3 domax 2024-04-17 10/500 2024-04-17 21:25 by 东方花园小万
[有机交流] 怎么清洗烧瓶 20+5 ww34523 2024-04-16 6/300 2024-04-17 15:20 by 591950582
[基金申请] 迟国泰通过向学生发放劳务费再回收的方式套取科学基金重点项目 +6 babu2015 2024-04-13 7/350 2024-04-16 20:32 by sundiv
[考博] 25年申博求助,射频方向 +4 SherlockAH 2024-04-15 10/500 2024-04-16 18:06 by ljysudaee
[考研] 329求调剂 +6 Kaylawander 2024-04-13 7/350 2024-04-16 12:00 by 风来花开1
[考博] 博士申请 +5 啦啦啦3737 2024-04-13 9/450 2024-04-16 07:07 by 1147wzzzz
[考研] 329求调剂 +18 王郁洁哈哈哈 2024-04-14 26/1300 2024-04-15 19:10 by mumin1990
[考研] 化学、材料类最后调剂机会!!! +3 加油努力就好 2024-04-14 10/500 2024-04-15 09:05 by 任pen
[考研] 287求调剂 +6 南沨 2024-04-14 6/300 2024-04-14 23:08 by lincunhui
[考研] 278求调剂 +4 月亮就蒜 2024-04-13 5/250 2024-04-14 23:03 by 永字号
[考研] 290求调剂 +3 杨yhr 2024-04-14 5/250 2024-04-14 21:50 by coco1981
信息提示
请填处理意见