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wsp871117

新虫 (小有名气)

[求助] 提交Treebase 时,用Mesquite生成的Nexus格式后 最后凭空多出两列(没有碱基)?已有1人参与

我的ITS 矩阵在Bioedit中显示,总的字符长度是663。但是,fas格式用Mesquite打开后,自动生成的NEX文件中,总字符长度变成 665 ??
同时,Mesquite中显示的矩阵最后也多了两行(664.665),而且这两行是空的没有任何碱基。这是为什么啊。。??

我又用clustalX生成NEX的文件中,总碱基字符长度跟Bioedit里面一样,也是663。这到底是什么情况呢?

因为要用Mesquite生成Nex 提交到TREEBASE 中,担心碱基字符数和文章中描述的不符(文章中基于Bioedit矩阵进行ITS区间描述,也就是一共663个碱基数)会有问题,所以,请各位大神赐教!~~~~~非常非常感谢~

提交Treebase 时,用Mesquite生成的Nexus格式后 最后凭空多出两列(没有碱基)?
QQ图片20160329111754.png
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wsp871117

新虫 (小有名气)

如图,最后两列 是空的。
2楼2016-03-29 11:19:47
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sheroyuan

新虫 (初入文坛)

您好,我最近在学习mesquite软件,有好多不明白的地方,请问您有中文说明吗?谢谢啦
3楼2016-05-09 16:47:29
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1670203422

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

您好,我是一名Mesquite的初学者,想通过Mesquite建立矩阵,然后通过tnt与winclada建树,但我在Mesquite上建完矩阵后,在tnt上运行最大数集部分的New technology search时,tnt系统总是报错,内容如下:Give min. size of random sectors(5 or more),经过我排除检测,应该是矩阵上的问题,故我想向您请教请教,在使用Mesquite编辑矩阵时,此软件对输入内容格式等方面有什么要求。如果可以,您可以加下我的qq(1670203422),以便我们交流,谢谢。
4楼2018-04-17 17:18:00
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