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为什么我的模拟结果原子不动 - 分子模拟 - 小木虫 - 学术 科研 互动社区
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为什么我的模拟结果原子不动

作者 TW九九
来源: 小木虫 200 4 举报帖子
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units                  metal
dimension                     3
boundary                     f f p

atom_style                   atomic
neighbor                     2.0 bin
neigh_modify                 every 1  delay 5 check yes

region                             box block 0 169 0 168 0 400
create_box                   2 box

region                       wall_left block 0 4 0 168 0 400
region                       wall_right block 164 169 0 168 0 400
region                 wall_down block 4 164 0 4 0 400
region                 flow block 4 164 4 44 0 400

lattice                             fcc  5.738
create_atoms                 1 region flow

lattice                             fcc  3.483
create_atoms                 1 region wall_left
create_atoms                 1 region wall_right
create_atoms                 1 region wall_down

mass                               1 39.948
mass                               2 39.948

pair_style                   hybrid  lj/cut 8.5  dpd/tstat 86 86 8.5 34387
pair_coeff                   1 1 lj/cut 0.0103125 3.4
pair_coeff                   1 2 lj/cut 0.00515625 3.4
pair_coeff                   2 2 lj/cut 0.00515625 3.4
pair_coeff                   1 1 dpd/tstat 0.0672 8.5
comm_modify            vel yes

group                         1 region wall_left
group                         2 region wall_right
group                         3 region wall_down
group                         wall union 1 2 3
group                  flow region flow
group                         Ar subtract all wall
set                           group wall type 2

velocity               flow create 86 482748 mom yes rot yes
compute                1 Ar chunk/atom bin/2d x lower 2 y lower 2 units box

velocity               wall set 0.0 0.0 0.0
fix                           1 wall setforce 0.0 0.0 0.0
fix                    5 flow ave/chunk 100 5 500 1 density/mass file c_0.5.profile

timestep                     0.005
thermo                             1000
thermo_style           custom step temp pe press density etotal

dump                   1 all custom 1000 c_0.5.dump id type x y z
run                    310000

想问下为什么我这个in文件跑出来的结果原子完全不动,我明明也对flow原子施加了速度,    后来我又试着加上fix  nvt命令,结果原子动的太快也不是想要的结果,有人知道吗。 返回小木虫查看更多

今日热帖
  • 精华评论
  • luyaobao

    velocity只是创建初始速度,需要加上fix nve

  • jluchemlib

    你没有对粒子的位置和速度进行积分,需要加fix nve或nvt这样的命令

  • TW九九

    我现在是在做复现别人的文章的工作,这篇文献中之前的模拟只要采用nve、nvt这类的就会明确说,现在这个模拟文献中并没有说采用这种,所以我就没加,发现结果不动以后我也对照我之前的模拟,也感觉是没有加nve、nvt这种的问题,所以我试着加上这样的命令,结果是原子运动太快,几千步就丢失原子了,

  • mpiyq

    文献可以贴一下吗

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