优化一个分子闭环到开环的过渡态,第一次选择使用qst2进行优化,三天了,还没有跑完,我是应该截取中间态来做opt=ts呢?还是继续让它跑着呢? 输出log文件见附件。
首先,你的计算只用到了一个核心。没用多核心并行。那算几天其实也就是算了几十步优化而已。 而且从优化的整体趋势来看 已经偏离开环的过渡态很远了,说明 通过初始和末态结构,QST2暴力求坐标差值的方法 并没有给出一个合理的结构,导致过渡态优化不出来。可以自己猜个结构 然后用OPT=TS 试试看。
估计还是你初始结构有问题,把要成环的2个原子固定在2A(或2.2A),优化后直接用ts试试?
首先,你的计算只用到了一个核心。没用多核心并行。那算几天其实也就是算了几十步优化而已。 而且从优化的整体趋势来看 已经偏离开环的过渡态很远了,说明 通过初始和末态结构,QST2暴力求坐标差值的方法 并没有给出一个合理的结构,导致过渡态优化不出来。可以自己猜个结构 然后用OPT=TS 试试看。
做了势能面扫描,从中间截取了过渡态出来重新做了opt=ts,结果还没看到
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估计还是你初始结构有问题,把要成环的2个原子固定在2A(或2.2A),优化后直接用ts试试?