铂催化的氢化加成反应过渡态计算
我想通过gaussian 09w计算铂催化的油酸(含有一个双键的18碳脂肪酸)的氢化反应。目前已经完成结构的优化和频率分析，想对过渡态和反应能垒进行分析，但是不知道接下来该如何做，求大神指点。我该如何画gjf文件，氢 铂和油酸是一个什么样的状态？反应机理如图。 还有我在哪里可以设置反应的温度？
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参考手册或者教程，网上找找
具体怎么摆这个最好查查文献。有没有人以前算过这个类似的路径。你学着画就行。如果找不到文献。那你就得自己从反应物自己判断出TS的大概结构。或者通过路径这种平面图 用你的“化学直觉”这种有些玄学的玩意自己判断一下可能的结构。当然可以通过柔性扫描之类的方法帮你“猜”出过渡态的结构。 比较通用的做反应路径的方法可以参考我这个教程的 1.10节 http://muchong.com/t-14242735-1 论坛里也各种讨论过过渡态的问题。可以搜搜，