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分子动力学模拟中的相互作用能

作者 ty_唐
来源: 小木虫 150 3 举报帖子
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为什么我跑完动力学算出来的相互作用能量达到了几万KJ/mol,最低的时候也有七八千……求各位大神指导下,能量在多少范围内是合理的?
(计算公式:E总-Ea-Eb)

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  • 精华评论
  • 寻道上高楼

    不是得吉布斯自由能小于0,才能自发结合吗

  • ty_唐

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by 寻道上高楼 at 2020-08-05 16:12:54
    不是得吉布斯自由能小于0,才能自发结合吗

    不好意思,忘了说是负的,但是负的很大。文献中看到的大多只有负的几百KJ/mol

  • 寻道上高楼

    一般认为配体与受体结合的构象稳定时能量越低,发生的作用可能性越大,结合能≤?5.0 kJ/mol
    作为筛选标准。

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