分子的尺寸一般来说可以考虑分子的范德华半径（比如定义 电子密度0.001 au作为分子范德华体积的边界。）然后找到这个边界之后找出分别长宽高最长的距离就是分子的尺寸了。
可以用Multiwfn来完成这个。

1. 用高斯优化分子
2. 保存chk文件，并转化为fchk文件。
3. 用Multiwfn打开fchk文件。
4. 输入 100---》21---》size---》1 Visualize the new orientation and molecular box  
5. 会弹出一个窗口 可以看到如截图中所示的样子。

截图中是算的 苯胺分子 蓝色方框框住的就是x y z 方向上的范德华直径。

dislin.png

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结构优化关键词就是opt 。至于高斯的基本用法木虫上各种入门教程很多的。属于一两句话说不清楚 但是又是很简单的操作。所以去看看教程效果会好。