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请教势函数的书写哪出错了?

作者 huanghehua
来源: 小木虫 150 3 举报帖子
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之前有一个写法正确但准确性并不好的势函数,其余不动只替换成下图中的势函数之后报错,应该是势函数的写法上出了问题,希望可以得到老师们的指导

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请教势函数的书写哪出错了?-1
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  • 精华评论
  • 华强

    Lost atom, 原子丢失了。一开始有376个,在第一步的时候,LAMMPS发现只有127个了,然后就报错告诉你原子丢失了。这个错误通常是对原子做某种操作造成的原子丢失,这部分在你设置势函数之后。就你截图的来看,你应该是对原子做了某个热学处理,因为报错是由thermo这个cpp文件反馈回来的。你检查一下是不是对原子的操作那部分出了问题。

  • huanghehua

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by 华强 at 2019-09-09 20:36:34
    Lost atom, 原子丢失了。一开始有376个,在第一步的时候,LAMMPS发现只有127个了,然后就报错告诉你原子丢失了。这个错误通常是对原子做某种操作造成的原子丢失,这部分在你设置势函数之后。就你截图的来看,你应该 ...

    感谢,检查了thermo之后,不出现原子丢失,方便再请教一下,在上图中也可以看到,能量最小化过程中的etotal数量级极大且无法收敛,之后在fix 1 all npt 1.0 1.0 0.1 iso 0.0 0.0 1.0 drag 0.2过程中dump原子相对位置没有发生改变,但盒子的体积在不断缩小,导致最终报错近邻表太大,我该往哪个方向修改

  • oxox6085

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by huanghehua at 2019-09-10 07:37:34
    感谢,检查了thermo之后,不出现原子丢失,方便再请教一下,在上图中也可以看到,能量最小化过程中的etotal数量级极大且无法收敛,之后在fix 1 all npt 1.0 1.0 0.1 iso 0.0 0.0 1.0 drag 0.2过程中dump原子相对位 ...

    多贴点input可能会知道,感觉是没加上电荷

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