forcite计算rdf求助。
我想计算体系中两个带苯环分子间的π—π作用。于是将两个分子的所有支链原子都去掉后 分别作为set1和set2。然后使用forcite—analysis进行了计算。得到了图中的结果,发现两个分子,有total,inter,intra三条曲线。inter曲线几乎是0。想知道这个意思是两个分子间没有π—π作用力?还是应该看intra。不太清楚两个分子的intra和inter是啥意思,有没有大佬解释一波。
这个方法分析π—π作用力可行吗。如果我加入另外一个分子进去,纵坐标变小,是否可以代表作用力变小。小白求教。后两个图是计算结果。
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传了两张重复的,不好意思了各位。
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