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请大家帮忙看看这个系统发育树

作者 auntwang: 来源: 小木虫 400 8 举报帖子

救命啊！！学渣请教一下大家，我分离的菌株，提取DNA，然后用27F和1492RPCR后，双向测序，双向测序的序列用ContigExpress拼接后在NCBI里blast,然后选取和菌株序列相近的菌株构建系统发育树，为什么构建的树数值这么低啊。拜托大家帮我看一下吧！

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精华评论

auntwang

这里面的数值都算大的了。好多菌株做出来可能只有十几二十左右
home微雪

掐头去尾试试
auntwang

引用回帖:
3楼: Originally posted by home微雪 at 2019-03-05 16:27:49
掐头去尾试试

我掐头去尾了。还是怎样。啊，哭泣了，不知道究竟怎么回事
，
宝宝肉肉

同学，我做出来的数值更低，请问你的建树用的菌株是怎么选择出来的？
杨行1003

你好楼主，问题解决了么，我也遇到这种问题
子夜君xi

我知道怎么回事，我之前就遇到过，在NCBI里找相似菌，然后看序列方向是否一样，就是要那个plus/plus。然后把那个序列复制粘贴在记事本上，不要直接直接fasta下载，虽然不知道是什么原因，但是这样建出来的相关性会更高