如图,氨分子一定不是平面状的。我把最开始分子故意设置成平面,想看计算后有用没。 图一是输入文件,图二是输出文件,经计算后构型貌似没有得到优化。换水分子也这样 QQ图片20190126143050.png QQ图片20190126143129.png 返回小木虫查看更多
哇,你去结构实验室了?
觉得这是程序计算的问题,对氨分子平面优化成锥形,会挪动原子看能量变化,现在是平面,向两个方向挪动原子能量变化是一样的,程序就不能进行了。只要初始有一点锥形,优化才能进行。水分子是平面的,优化当然还是平面。
同意4楼。Gaussian09 默认有symm命令 就是opt的时候倾向于不破坏初始的对称性。并且这个平面结构恰好也是一个势能面上的顶点 只不过这个不是最低点而是最高点也就是过渡态而。如果同时做freq计算就会发现有一个虚频。 这种情况下人为加入 nosymm命令 估计都还是会得到平面结构。解决方法就如4楼所说 改一改初始结构 破坏初始的对称性就行,
你这算出来肯定有虚频吧
哇,你去结构实验室了?
觉得这是程序计算的问题,对氨分子平面优化成锥形,会挪动原子看能量变化,现在是平面,向两个方向挪动原子能量变化是一样的,程序就不能进行了。只要初始有一点锥形,优化才能进行。水分子是平面的,优化当然还是平面。
同意4楼。Gaussian09 默认有symm命令 就是opt的时候倾向于不破坏初始的对称性。并且这个平面结构恰好也是一个势能面上的顶点 只不过这个不是最低点而是最高点也就是过渡态而。如果同时做freq计算就会发现有一个虚频。 这种情况下人为加入 nosymm命令 估计都还是会得到平面结构。解决方法就如4楼所说 改一改初始结构 破坏初始的对称性就行,
你这算出来肯定有虚频吧