想鉴定昆虫某组织的蛋白,但是做完质谱发现没有该物种的蛋白组数据库,只有基因组,该怎么分析得到的质谱结果呢 返回小木虫查看更多
用肽序列从头测序de novo的方法
没有数据对比只能de novo测序了,一般手段就是用多种蛋白酶水解目的蛋白质,对比如用蛋白酶A,B,C和D对蛋白质酶切,然后分别对A,B,C和D酶切的片段打质谱,然后拼接,只要所有的氨基酸都被覆盖,最后结果是很准确的,
谢谢大家,但是de novo测序老板怕是不同意
用肽序列从头测序de novo的方法
没有数据对比只能de novo测序了,一般手段就是用多种蛋白酶水解目的蛋白质,对比如用蛋白酶A,B,C和D对蛋白质酶切,然后分别对A,B,C和D酶切的片段打质谱,然后拼接,只要所有的氨基酸都被覆盖,最后结果是很准确的,
谢谢大家,但是de novo测序老板怕是不同意