输入文件用记事本打开，然后贴出来 会有人告诉你怎么回事。原因挺简单的，而你描述的看着真费劲。

最好有output文件传上来这样比较容易看出问题。  光看这个提示 你可以试着把 input文件里面  geom=connectivity 这个语句删除掉  然后 把分子的坐标之后 那一段各种数字（这段数字就是定义connectivity的， 可以不写）去掉 没准就行了。

这是输入文件，大神们帮忙看看

%chk=gaosi.chk
#p opt freq b3lyp/genecp

Title Card Required

0 1
C                  1.11944947    1.41298242    0.42247084
C                  0.55368647    2.00131442    1.56875984
C                  0.40332247    3.39559642    1.61721984
C                  0.82852347    4.17161442    0.52734184
C                  1.41085847    3.58887742   -0.60663616
C                  1.56327247    2.19309742   -0.66002316
H                 -0.03202953    3.88613742    2.48572784
H                  0.71252747    5.25066742    0.56842684
H                  1.74158847    4.22427742   -1.42595416
C                  0.22368247    0.99067742    2.55939784
N                  0.52928047   -0.24004258    2.25942084
C                  2.16886847    1.36415042   -1.68393616
N                  2.21595247    0.07923842   -1.45196016
Rh                 1.38261147   -0.55187558    0.38040484
H                  1.35201900   -2.48604700    0.14620000
H                 -0.99583900   -3.21864100    0.08948100
C                 -0.66774700   -2.65003100   -0.77365400
C                 -1.31293700   -1.45531600   -1.08867500
H                 -0.13487900   -3.20070700   -1.53910000
H                 -1.21877300   -1.01853100   -2.07654700
C                 -2.43998800   -0.95927400   -0.27361600
O                 -3.05244400    0.08656600   -0.89012600
H                 -0.25594253    1.22959642    3.51043084
H                  2.58987847    1.78043442   -2.60197216
H                  2.67607547   -0.48111258   -2.16605416
H                  0.26198147   -0.94756858    2.93902684
C                 -4.18254000    0.62785900   -0.19782600
H                 -4.56643800    1.42340300   -0.83800500
H                 -4.94612500   -0.13941900   -0.04036500
H                 -3.88542200    1.03294800    0.77384000
B                  3.31862164   -0.45596466    1.26333504
O                  4.53130401   -0.22515397    0.33570535
O                  3.54236710   -0.62155083    2.79781047
C                  4.50825900   -0.09405357    3.41076345
C                  5.61081283    0.35971305    0.92014161

C N H O B 0
6-31g*
*****
Rh 0
Lanl2dz
******

Rh 0
Lanl2dz，

0不懂别人输入文件里面关键词意思就拿来用，是在作死
1geom=connectivity没删掉
2明明使用带赝势基组的混合基组前面还写个b3lyp/6-31g 好好阅读Gaussian说明书学习genecp是啥意思
3用#P是个好习惯 请养成
4 B原子的定义呢？是要说没注意吗
5好好学习赝势基组混合基组的写法 没事别瞎空行http://sobereva.com/60

6 在linux下计算 就别写win下面的文件路径存储chk了。