vmd用的少，不知道可以，ovito应该可以的

vmd肯定能，把水分子设置一下

颜色选为青色，材质选为glassbubble。

引用回帖:

6楼: Originally posted by 7152075 at 2018-05-26 07:15:55
颜色选为青色，材质选为glassbubble。

求问能具体讲解一下么，没找到怎么应用。。

引用回帖:

4楼: Originally posted by idiot065 at 2018-05-24 17:06:27
vmd用的少，不知道可以，ovito应该可以的

使用VMD中的Tachyon渲染出透明逼真的水盒子效果：https://blog.csdn.net/mt811/arti ... 1001.2014.3001.5501
以上教程很详细，对你这个图,你对着教程看一遍，注意以下三个要点即可达成你想要的水盒子小工：
0.在VMD Main窗口开启---->Display----->Rendermode---->GLSL
1.颜色，选择Coloring Method-->ColorID --->(对应的颜色编号，目测看起来是：cyan),颜色可以自己调
2.材质（Material）--->Transparent,即可你图中的透明的效果
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