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请问如何使用MS对单体进行扩大?

作者 宇轩0128
来源: 小木虫 350 7 举报帖子
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做了一个单体,要进行扩大,但是扩大出来的好像就是简单的复制了一遍。图一是已经做好的单体,图二是自己用MS扩大的,图三那个框架是我想要得到的。但是我弄不成那样的,求大神解决谢谢。

请问如何使用MS对单体进行扩大?
图一


请问如何使用MS对单体进行扩大?-1
图二


请问如何使用MS对单体进行扩大?-2
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  • 精华评论
  • dingweilu

    楼主的图二跟图三不一样啊。

  • may_gloomy

    LZ你建模有问题哦,,,MS确实是简单重复构建的,

    所以你图1中的分子如果是单晶胞里面的完整体只能得到图2这样的复制

    如果想得到图3这样的构型,,,需要考虑分子连接处的重复分子,把晶胞之间重复位置的原子处理好才行

  • 宇轩0128

    引用回帖:
    6楼: Originally posted by may_gloomy at 2018-05-02 13:35:34
    LZ你建模有问题哦,,,MS确实是简单重复构建的,

    所以你图1中的分子如果是单晶胞里面的完整体只能得到图2这样的复制

    如果想得到图3这样的构型,,,需要考虑分子连接处的重复分子,把晶胞之间重复位置的原子 ...

    那请问这个重复位置的原子怎么处理呢?

  • may_gloomy

    引用回帖:
    7楼: Originally posted by 宇轩0128 at 2018-05-07 10:00:19
    那请问这个重复位置的原子怎么处理呢?...

    如果你想得到图3那种模型,最简单的办法是用一个晶胞把图三那个模型截取出1/4,这样就会大概知道那些原子是公用的,重新建模就行,,

    就现在所看到的,图1都不算最小单元,,,可以选取图1的1/4来从头建模,做好基本单元后,再Dispaly里面重复单元增大a,b方向,如果还原回图1,那么用supercell造图3就好

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