我使用的动力学软件为AMBER14，体系为含水的复合蛋白，动力学过程中，产生的拓扑文件都没有报错，但是在结合自由能分解时报错显示CalcError: /home/hxduan\bin\amber14\bin\sander failed with prmtop nwt_protein.prmtop!想请教一下这是什么原因的导致的，完全没有头绪。我使用的是含水分子的蛋白，之前把水分子的原子类型定义成了钾，随后的操作跟不含水分子的蛋白操作一样，我使用的tleap文件如下：
source ?leaprc.gaff
source ?leaprc.ff03.r1
UNK = loadmol2 ?ligand.mol2
loadamberparams ?ligand.frcmod
check UNK
list
saveamberparm UNK nwt_lig.prmtop ?nwt_lig.inpcrd
rec = loadpdb receptor.pdb
saveamberparm rec nwt_rec.prmtop nwt_rec.inpcrd
com = loadpdb protein.pdb
check com
saveamberparm com nwt_protein.prmtop ?nwt_protein.inpcrd
addions com Na+ ?0
#addions com CL- ?0
solvateoct com TIP3PBOX 12
saveamberparm com protein.prmtop ?protein.inpcrd
saveamberparm UNK lig.prmtop ?lig.inpcrd
rec = loadpdb receptor.pdb
saveamberparm rec rec.prmtop rec.inpcrd
quit
请问含水的蛋白复合体应该怎么处理?

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