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DPD模拟中每种珠子的体积设置成一样,质量也要一样吗?

作者 太阳下的撒旦
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DPD模拟中每种珠子的体积设置成一样,质量也要一样吗?教程里面为什么把体积和质量都设置成一样的? 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • luyaobao

    这取决于你研究的对象,一般都是一样的

  • 太阳下的撒旦

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by luyaobao at 2018-03-13 20:16:32
    这取决于你研究的对象,一般都是一样的

    谢谢你的回复,请问像图中这种划分珠子的方式,原文中“在该粗粒化体系中,体积最小的粗粒化珠子 TH-代表了一个 CH2SH 分子基团,为了保证体系统一的粗粒化标准就将这个珠子定义为标准珠子,对应的体积为 87Å3。”意思是每种珠子体积都设为87,那质量是按照实际值设置还是和标准珠子一样?
    DPD模拟中每种珠子的体积设置成一样,质量也要一样吗?
    QQ截图20180313211702.png


  • luyaobao

    我的理解是这个标准珠子的体积和质量都为1,然后其余类型的珠子按实际比例scale。即,如果标准珠子设为实际值,其余也为实际值

  • lovechemi

    体积一样,质量还可以一样吗???

  • 生物能源

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by 太阳下的撒旦 at 2018-03-13 21:25:37
    谢谢你的回复,请问像图中这种划分珠子的方式,原文中“在该粗粒化体系中,体积最小的粗粒化珠子 TH-代表了一个 CH2SH 分子基团,为了保证体系统一的粗粒化标准就将这个珠子定义为标准珠子,对应的体积为 87Å ...

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