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请问物种丰度聚类热图如何分析

作者 Acousma
来源: 小木虫 150 3 举报帖子
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物种丰度聚类热图是横向比较还是纵向比较,在文章中如何分析,看了几篇文献,没太看懂,如何看出优势菌群和相对丰度较高的菌群?

请问物种丰度聚类热图如何分析
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  • 精华评论
  • 小冀-

    横向纵向都要比较吧,我觉得横向的是不同样本之间的差异,纵向是同一组样本内物种的分布情况,不知道这么理解对不对

  • Acousma

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by 小冀- at 2018-03-01 11:10:57
    横向纵向都要比较吧,我觉得横向的是不同样本之间的差异,纵向是同一组样本内物种的分布情况,不知道这么理解对不对

    我理解的是横向比较是某一中菌在这几个样本中所占的相对丰度,相对丰度高则颜色深,但不一定是含量高

  • 小冀-

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by Acousma at 2018-03-01 16:29:48
    我理解的是横向比较是某一中菌在这几个样本中所占的相对丰度,相对丰度高则颜色深,但不一定是含量高...

    既然相对于其他菌株而言相对丰都比较大,是不是说明其数量占优势呢?

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