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用sybyl X 做Comfa, 总觉得哪里有问题,但是却弄不明白。

作者 Aladeen
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   Subject:  TAILOR!PLS

Option Name         Description                               Value
-----------         -----------                               -----

BOOTSTRAPPING       Number of bootstrap runs to make          0
CENTERING           Force intercept thru 0.0?                 NO
COMPONENTS          Number of components to use               4
CROSSVALIDATION     Number of crossvalidation groups          21
EPSILON             Convergence criterion                     1.e-4
ITERATION           Maximum number of iterations              100
SCALING_METHOD      Pre-analysis scaling (COMFA_STD for CoMF  COMFA_STD
XLIST               Print info about xval groups?             NO

Computation index is 349272.

Computation index is 349272.
Standard Error of Predictions (Crossvalidated)  
Run  #       Comp1     Comp2     Comp3     Comp4  
---  -     --------- --------- --------- ---------
  1  1 pKd     1.038     1.130     1.348     1.305
Optimum # of components is 1.
R squared                        -0.583
Relative Contributions
Run 1

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.211     0.467
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.523     0.533

Run 2

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.124     0.648
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       1.155     0.352

Run 3

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.315     0.485
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.455     0.515

Run 4

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.217     0.511
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.120     0.489

Run 5

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.248     0.476
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.477     0.524

Run 6

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.358     0.500
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.357     0.500

Run 7

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.541     0.547
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.107     0.453

Run 8

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.340     0.492
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.418     0.508

Run 9

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.537     0.489
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.653     0.511

Run 10

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.327     0.491
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.410     0.509

Run 11

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.411     0.497
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.441     0.503

Run 12

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.222     0.490
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.316     0.510

Run 13

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.229     0.473
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.486     0.527

Run 14

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.383     0.491
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.472     0.509

Run 15

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.427     0.519
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.247     0.481

Run 16

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.062     0.480
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.231     0.520

Run 17

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.450     0.494
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.513     0.506

Run 18

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.293     0.510
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.200     0.490

Run 19

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.346     0.502
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.329     0.498

Run 20

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.317     0.484
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.467     0.516

Run 21

#                                   Norm.Coeff. Fraction
-                                   ----------- ---------
1 COMFA7 (343 vars) (Steric)              2.283     0.479
2 COMFA7 (343 vars) (Electrostatic)       2.485     0.521

Summary output
Standard Error of Predictions (Crossvalidated)  
Run  #       Comp1     Comp2     Comp3     Comp4  
---  -     --------- --------- --------- ---------
  1  1 pKd     1.038     1.130     1.348     1.305
Optimum # of components is 1.
R squared                        -0.583

=================================================================
以上是输出结果,不知道出了什么问题。有哪位大神能够赐教,不甚感激。
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