是常用的细菌，例如E.coli S. aureus或Bacillus 这些有遗传操作的菌还是环境中分离的菌？如果是常用菌，可以构建荧光蛋白，通过对荧光量进行定量分析。如果是环境分离的菌，可以用半透膜将两种菌隔离，使其能够感应对方存在，而不会混合，

共培养通常用的是overlay。液体培养不太好做啊，构建GFP的话，很可能会改变菌株的性状，我建议是用FISH，荧光探针法。或者简单点，直接qPCR，定量分析，记得要加2组内参

如果不同的菌，直接分析混菌中16SRNA占比就好了吧，就像宏基因组那样~如果是相同菌经过改造之后混菌的话，就比较麻烦了，得找特应性的特征~

不知道题主做的具体哪两种菌。如果培养菌落好区分，可以稀释涂布平板计数。如果菌落不好区分，可以尝试下选择培养基计数 。

可以先将这两种菌各平均分成2个等份，提供四份平行的液体培养基，将四分菌放入四分培养基中，培养一代后，将其中的两份合并，然后定期测三种菌的OD值，间接测定。

我也想做。想问楼主用了什么方法？