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16S rRNA和高通量测序

作者 黄双蕾_环科
来源: 小木虫 350 7 举报帖子
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我做微生物水处理的,现在培养了一个污泥,做了FISH发现有厌氧氨氧化菌,想做一个16S rRNA和高通量测序,但是我们是传统的水处理方向,没有相关设备和经验。现在想找一家公司做这两个分析,我们只负责送样品,提取、扩增、测序、分析都由公司来做,样品数量为10个左右,请各位虫友提供一些做这方面的公司的信息,谢谢谢谢! 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • 飞雪踏春

    现在做高通量的公司很多,目前国内测序行业的老大是华大基因。诺禾致源则是专注高通量测序,目前为全国测序平台通量最大公司,而且只需要提供样本即可。个人认为这两个公司较好。

  • 小楚丶

    预测为浮霉状菌,红色菌体,丰富在20%-30%间

  • e生物圈

    华大基因都上市了,市值千亿,诺禾致源也是很厉害的公司。不过嘛,楼主的实验其实也并不是太复杂,市场上也有很多其他公司可以做,除了华大和诺禾,金唯智,贝瑞和康,博奥生物,百迈克,爱普益,泛生子,中美泰和,达安基因,安诺优达,美因基因。。。。简直不要太多了,可以说只要有测序仪都能做。不过告诉你一个事情,有的大公司的测序可能都不是自己测得,也是包给其他小公司,你的实验样品量不够的话还会碰上排队上机,凑line。所以吧,还是多跟公司沟通一下。对于你这个实验,如果实验比较重要的话,建议你找一些有经验的,专做16S的给你做菌株鉴定,高通量呢找后面分析能力强的。华大和诺禾固然很好但其他公司也是不错的。你在哪个城市啊?样品如何邮寄,实验周期,价格等等都提前问好。最后祝好,

  • 黄双蕾_环科

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by 飞雪踏春 at 2017-11-14 22:26:46
    现在做高通量的公司很多,目前国内测序行业的老大是华大基因。诺禾致源则是专注高通量测序,目前为全国测序平台通量最大公司,而且只需要提供样本即可。个人认为这两个公司较好。
    ...

    谢谢提供的信息

  • 黄双蕾_环科

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by e生物圈 at 2017-11-14 23:29:02
    华大基因都上市了,市值千亿,诺禾致源也是很厉害的公司。不过嘛,楼主的实验其实也并不是太复杂,市场上也有很多其他公司可以做,除了华大和诺禾,金唯智,贝瑞和康,博奥生物,百迈克,爱普益,泛生子,中美泰和, ...

    谢谢,这些信息对现在啥也不懂的我实在是太重要了,来的太及时了,谢谢

  • nsa0804

    厌氧氨氧化菌最好做一下绝对定量,高通量测序建议做功能基因的测序这样可以获得种的信息,如果针对16S rRNA基因测序只能到属。看你的实验目的了,祝你成功。

  • 小马科研部落

    16S通用引物对功能基因的检出率不是太好。
    建议检测厌氧氨氧化菌的功能基因,可以用二代高通量测序技术、选择厌氧氨氧化菌的特异性引物来做。
    我们公司已经给中科院生态中心、南京土壤所检测过厌氧氨氧化菌哈。

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