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进行微卫星位点搜索

作者 sunshine小辛
来源: 小木虫 250 5 举报帖子
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公司给我们的转录组测序原始文件是fq格式,且超过8G,用移动硬盘保存,电脑配置是8G,64位,电脑里无法打开。想请教各位,用什么软件可以打开该文件。然后需要将fastq格式转成fasta格式,进行微卫星位点搜索?急需 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • 咖啡小屋~~

    linux上可以直接查看,win下不清楚

  • niil

    这么大的文件很难用可视化程序打开的。fastq格式文件里每四行存储一条序列信息,需要把第一行第二行取出来就可以转换成fasta格式,找一个会编程的朋友编一个简单的脚本就可以了,linux系统里用awk 也行。

  • sunshine小辛

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by niil at 2017-11-14 22:05:07
    这么大的文件很难用可视化程序打开的。fastq格式文件里每四行存储一条序列信息,需要把第一行第二行取出来就可以转换成fasta格式,找一个会编程的朋友编一个简单的脚本就可以了,linux系统里用awk 也行。
    ...

    谢谢

  • 是冰不是水

    想请问你 打开了吗

  • drwhoknowss

    建议找一个知道些信息学的人帮你解决问题。你的做法too naive

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