山东大学

你基础水平如何，基础好可以试试中科院微生物所

微生物的方向目前比较火的是肠道微生物以及利用微生物进行生物合成，山大微生物不建议了，目前重点实验室已经进行整改了，不过有几大大牛的实验室还是可以选的。上海交大挺好的

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基础一般，中等偏上水平的学校和实验室就好

看你自己的读研的目的了。只是要个学位还是真的想要做点成绩，还有自己的兴趣，偏资源，偏医学还是偏应用。微生物选择面还是挺广的。