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氢键与其他弱作用力存在时，能单独求出氢键的大小吗

作者 xiemeng101: 来源: 小木虫 300 6 举报帖子

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欲计算分子间的氢键的大小，从文献得知这两个分子之间存在氢键(占主导作用)和其他的弱相互作用，有什么办法能抛开其他作用力而单独计算氢键的大小吗？返回小木虫查看更多

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jiewei

假设分子1为 AOH; 分子2 为BF
计算二聚体的能量E(AOH BF)，计算分子1的能量
将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用。这个时候分子1为AOH*。计算二聚体的能量E(AOH* BF)，计算分子1*的能量，
氢键的能量为： E(AOH BF) -E(AOH* BF)- （E1*-E1）
戴世杰

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2014-09-20 16:28:24
假设分子1为 AOH; 分子2 为BF
计算二聚体的能量E(AOH BF)，计算分子1的能量
将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用。这个时候分子1为AOH*。计算二聚体的能量E(AOH* BF)，计算分子1*的能量，
...

我觉得E1*-E1没有必要考虑，计算E(AOH* BF)的能量时，分子1和分子2的构型和成氢键时相同，只是没有氢键作用，不用优化直接计算SP，你觉得呢？
jiewei

引用回帖:
3楼: Originally posted by 戴世杰 at 2014-09-21 10:59:31
我觉得E1*-E1没有必要考虑，计算E(AOH* BF)的能量时，分子1和分子2的构型和成氢键时相同，只是没有氢键作用，不用优化直接计算SP，你觉得呢？...

我觉得你说得不对，人家前提是明确有提示说氢键只是主导，而不是全部作用力。如果照你的说法最后的结果色散会被你纳入氢键的作用的
十年磨练

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2014-09-20 16:28:24
假设分子1为 AOH; 分子2 为BF
计算二聚体的能量E(AOH BF)，计算分子1的能量
将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用。这个时候分子1为AOH*。计算二聚体的能量E(AOH* BF)，计算分子1*的能量，
...

专家，你好：

我最近也在纠结这个问题，像你说的这种方法是在gaussian软件下得到的结果吧。但是，对于“将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用”这句话，我如果将两个分子放在一起使它们不形成氢键，但是通过opt之后还是会形成氢键的，难道是将他们放在一定的位置不形成氢键直接计算他们的总能量吗？

求解答，在此谢谢了
，
十年磨练

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6楼: Originally posted by jiewei at 2015-06-22 17:57:43
对高斯。
放远点
...

哦，那那样的话，他们之间的其他弱相互作用应该也就下差很大了吧。像你说的那样，一般放多远，有没有一个标准什么的？