【求助/交流】PCR的问题
扩一个基因,1314bp,GC含量约有63%。
25微升体系如下:引物 0.5/0.5
10乘buffer 2.5
dNTP 0.5
Taq酶 0.5
cDNA(模板)1
DMSO 1
ddH2O 18.5
扩增设计:95℃ 5min
95℃ 45s
58、63℃ 45s
72℃ 1min30s
72℃ 10min
4℃ hold
28个循环
扩了三次没有扩出来
GC含量高,一会准备换个GC buffer,但是师姐说那个没有什么用处。
请教各位大侠~~~ 返回小木虫查看更多
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1.退火温度,引物量,酶量等做几个梯度,优化一下。
2.模板在提纯一些
3.换换PCR仪
还不出的话,可能是引物设计的不好吧。你加DMSO就是说你的东西不好P,在好好弄弄引物吧。
63%的GC还不算太高
撤掉DMSO看看,DMSO不一定都是增强剂,有可能抑制PCR反应
另外,换个活力好的酶吧
我查了文献说DMSO在6%——13%时效果最好,低于4%或者高于20%就不行了,25微升体系1微升的DMSO,差不多是4%,那么应该再增加DMSO呀。。。
嗯,我再用高保真酶扩一下,谢谢
,
GC buffer还是有用的
我P过GC 72%的,只有加了GC buffer才行
Primer5设计的引物温度是65摄氏度,已经降了很多了。。。片段起始区GC含量就很高,没办法额
换个高保真酶试试。