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6%变性聚丙酰胺凝胶电泳SSR引物筛选

作者 XiaoyanY
来源: 小木虫 650 13 举报帖子
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我是SSR引物筛选新手,有好多问题呀,请各位高手指点迷津~
(1)我是跑的六一厂24B型号,很小的那种垂直电泳槽,染色时胶要与玻璃板脱离,我做的是1mm的6%变性聚丙烯酰胺凝胶,在固定、染色、显色的过程中要转移凝胶,胶很容易就弄碎了,请问有什么好方法可以防止胶块碎裂啊?
(2)我用的500ml的显色液,将两块胶一起染色,显色液中包括15g的Na2CO3,750ul的甲醛溶液和50ul的硫代硫酸钠,我是先将Na2CO3溶解在500ml的蒸馏水中,放入冰箱冷却,拿出来后再加入甲醛和硫代硫酸钠。在显色过程中显色不均是什么原因啊?就是条带有的出现的早有的出现的晚,最后导致有的染的特别深,有的染的特别浅。
(3)我用的方法都与之前师兄师姐跑的那种最大的玻璃板是一致的,只是因为胶更小,所以我用的试剂都按一定比例缩小了,就如上面的显色液的配方,缩小了1/4,这样做可行吗?
问题还有很多,急需各位帮助,谢谢啊! 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • 游侠892

    1、“胶块碎裂”是不是你配制的胶有问题。配方是不是存在问题。
    2、显色有深有浅,不知道是不是你的胶厚薄不均一?这种情况在我们实验室也出现过。
    3、缩小了1/4是什意思?浓度应该还是没变的,只是按比例减少而已。

  • XiaoyanY

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by 游侠892 at 2012-07-01 10:05:43
    1、“胶块碎裂”是不是你配制的胶有问题。配方是不是存在问题。
    2、显色有深有浅,不知道是不是你的胶厚薄不均一?这种情况在我们实验室也出现过。
    3、缩小了1/4是什意思?浓度应该还是没变的,只是按比例减少而已 ...

    1.我的配方是1LPAGE中含420g的尿素和150ml的丙烯酰胺/双丙烯酰胺(19:1)原液,100ml的10xTBE。之前师姐跑大板是用的这个配方,她用着没问题。但我也不清楚换做我这种小板会不会有什么问题···
    2.‘胶的厚薄不一’我觉得应该不可能,我两块玻璃之间都是由一样厚度的胶条隔开的,下方没有放胶条,除了插梳子的那一面我都用胶带封好了,也没见漏胶.在凝胶时也感觉放平了···
    3.就是浓度没变,只是按比例减少的意思。不知道这样转移使用本身有木有问题···

  • 虫虫博士

    1.胶易破碎,可能是因为染色-冲洗-显色等步骤,摇晃力道太大以及转移次数太多。我所有过程只用一个塑料盒,放到摇床上低速摇动,一帮不会烂胶,你可以试试。

  • 虫虫博士

    2. 染色深浅不一,还是因为染色或显色液不能均匀覆盖胶块,建议一个槽中凝胶不要放的太多,染色液特别是显色液尽量多些,使胶块充分地浸在水中。

  • 虫虫博士

    3. 染色/显色液的浓度本来就是可以调节的,只要能显出清晰的条带,就没有问题,可以继续使用。

  • XiaoyanY

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by 虫虫博士 at 2012-07-02 14:14:57
    1.胶易破碎,可能是因为染色-冲洗-显色等步骤,摇晃力道太大以及转移次数太多。我所有过程只用一个塑料盒,放到摇床上低速摇动,一帮不会烂胶,你可以试试。

    嗯,今天打算这样做,谢谢!

  • XiaoyanY

    引用回帖:
    6楼: Originally posted by 虫虫博士 at 2012-07-02 14:22:50
    3. 染色/显色液的浓度本来就是可以调节的,只要能显出清晰的条带,就没有问题,可以继续使用。

    谢谢~

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