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【求助】用Dmol3优化羟自由基输出文件中找somo

作者 紫鱼天堂
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RT.
近期用dmol3优化了羟自由基得到的部分输出文件如下:

Energy of Highest Occupied Molecular Orbital  -0.25437Ha    -6.922eV
  HOMO is orbital number     9
  LUMO is orbital number    10

    state                         eigenvalue        occupation
                              (au)          (ev)

    1   +   1   a        -18.839821      -512.658     1.000
    2   -   1   a        -18.815997      -512.010     1.000
    3   +   2   a         -0.911999       -24.817     1.000
    4   -   2   a         -0.857755       -23.341     1.000
    5   +   3   a         -0.413550       -11.253     1.000
    6   -   3   a         -0.391548       -10.655     1.000
   7   +   4   a         -0.346673        -9.433     1.000
    8   +   5   a         -0.277333        -7.547     1.000
    9   -   4   a         -0.254372        -6.922     1.000
   10   -   5   a         -0.226063        -6.151     0.000
   
11   +   6   a          0.037095         1.009     0.000
   12   -   6   a          0.045284         1.232     0.000


  Orbital occupation is:
    5  a  ( 1) alpha and   4  a  ( 1) beta
  Total number electrons:               9.0

从上面分析来看,羟自由基有9个电子,占据了前五个轨道,其中第五个轨道上有1个电子,那么羟自由基的SOMO轨道应该是第五个轨道吧
但是,如上面斜体,从各个轨道的特征值来看,第8行-5轨道的能值比第9行-4轨道的能值还要低,这样的话确定第五个轨道为SOMO对吗?

注:我使用的泛函是GGA/BLYP,基组选择的是DNP.
还请各位高手多多指点,感激不尽。。。

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-12-21 at 19:21 ] 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • ykwang

    根据SOMO的定义应该是:
    8   +   5   a         -0.277333        -7.547     1.000

  • 紫鱼天堂

    引用回帖:
    Originally posted by ykwang at 2010-12-21 17:20:24:
    根据SOMO的定义应该是:
    8   +   5   a         -0.277333        -7.547     1.000

    哦,这样的话就是说不用考虑他的特征值量大小了是吗?
    多谢多谢

  • ykwang

    引用回帖:
    Originally posted by 紫鱼天堂 at 2010-12-21 18:19:15:
    哦,这样的话就是说不用考虑他的特征值量大小了是吗?
    多谢多谢

    按照定义应该是这样。

  • 紫鱼天堂

    引用回帖:
    Originally posted by ykwang at 2010-12-21 18:31:46:


    按照定义应该是这样。

    额,还想请教一个问题。就还比如羟自由基吧,如果比较羟自由基容不容易进攻其他非自由基基团时,是不是拿羟自由基的SOMO与非自由基基团的HOMO或者LUMO相比较就可以了?与HOMO最接近的话就易得到电子,与LUMO接近的话就易失去电子?

  • ykwang

    引用回帖:
    Originally posted by 紫鱼天堂 at 2010-12-21 18:51:55:
    额,还想请教一个问题。就还比如羟自由基吧,如果比较羟自由基容不容易进攻其他非自由基基团时,是不是拿羟自由基的SOMO与非自由基基团的HOMO或者LUMO相比较就可以了?与HOMO最接近的话就易得到电子,与LUMO接 ...

    我从不用这种半经验规律讨论问题,所以无法判断。

  • farfaraway08

    引用回帖:
    1186677楼: Originally posted by 紫鱼天堂 at 2010-12-21 15:51:03
    RT.
    近期用dmol3优化了羟自由基得到的部分输出文件如下:

    Energy of Highest Occupied Molecular Orbital  -0.25437Ha    -6.922eV
      HOMO is orbital number     9
      LUMO is orbital number    10

        s ...

    楼主您好,请问如何在MS中建立羟基自由基的模型的?谢谢您

  • 紫鱼天堂

    引用回帖:
    1978167楼: Originally posted by farfaraway08 at 2012-09-25 15:40:33
    楼主您好,请问如何在MS中建立羟基自由基的模型的?谢谢您...

    我是按照MS自带的帮助文件来做的

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