没做过，不过你可以自己算一下，试试啊。

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Originally posted by wydzyx2003 at 2010-12-13 12:40:38:
没做过，不过你可以自己算一下，试试啊。

主要是现在时间不够，所以我想问一下，看有谁做过没有，可以指导一下，这样会省很多时间

请问你的问题解决了没有，我也遇到同样的问题，我在用dmol3进行过渡态搜索的时候反应物是两种物质，是把这两种物质放在一个3D文件里优化还是分别优化呢，这个问题困扰了很长时间，身边没有朋友用这软件，还请赐教哈！

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1961298楼: Originally posted by wangyoucheng at 2012-04-09 14:27:04:
请问你的问题解决了没有，我也遇到同样的问题，我在用dmol3进行过渡态搜索的时候反应物是两种物质，是把这两种物质放在一个3D文件里优化还是分别优化呢，这个问题困扰了很长时间，身边没有朋友用这软件，还请赐教 ...

我做两种物质在金属表面的共同吸附的时候，是先优化一种吸附物，后加入另一种吸附物质的。这样做具体和一起优化有没有差别我现在还不太清楚。
至于你的问题，我觉得是应该把两种物质放在一个3D文件中进行优化，这样在构造产物的时候也是在一个3D文件中，并且只有这样才能进行过渡态搜索的计算吧。要注意的就是优化前两个反应物之间的距离，保持适当的距离才能使二者之间没有作用力或者有作用力，这要根据你是否想让两者之间产生作用来调整了
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1961310楼: Originally posted by 紫石婴宁 at 2012-04-09 15:24:27:
我做两种物质在金属表面的共同吸附的时候，是先优化一种吸附物，后加入另一种吸附物质的。这样做具体和一起优化有没有差别我现在还不太清楚。
至于你的问题，我觉得是应该把两种物质放在一个3D文件中进行优化， ...

想请问一下怎么确定两种物质之间有没有作用力呢？ 我刚调整了两种物质之间的距离进行计算得到的结果每次都不一样，这样弄的我不知道哪个结果是对了呢？

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1961462楼: Originally posted by wangyoucheng at 2012-04-10 13:12:50:
想请问一下怎么确定两种物质之间有没有作用力呢？ 我刚调整了两种物质之间的距离进行计算得到的结果每次都不一样，这样弄的我不知道哪个结果是对了呢？

一般来说距离远的话就可以算没作用力，距离近的话就有相互作用。一般距离大于10 Å左右吧应该就可以算是没作用力了。你计算结果要是相差不大的话那也是可以的。其实这方面我也不是很懂，就是根据自己做的经验来说的。不知道你的体系是什么样的，还有你是希望他们之间有作用力还是没有？

您好，请问您这个问题已经解决了吗？