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【求助成功!】请教castep 通过命令或者pbs提交任务只能计算单点能,不能计算pdos!

作者 gongjijun
来源: 小木虫 1100 22 举报帖子
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最近用ms4.4,在集群上castep计算出现问题,表现如下:

设置任务时设置了计算能带,pdos,结果发现不能分析pdos,一切操作都是正常,在用网关的单机服务器上是可以pdos的。进一步分析发现,返回的结果文件中只有 name.castep 这个文件(name为文件名,以下同),还没有相应的 name_dos.castep,和name_BandStr.castep这两个文件,这样就不能够分析pdos了,在网关提交任务时是可以产生这两个文件的。也就是说castep在完成了第一步的单点能计算后就没有继续算能带和pdos了。

发现这个情况后我首先怀疑是集群软件安装问题,但是没有找出原因,
也试过换licence文件等等方法都没有解决。

后来在单机上也尝试用命令的形式提交任务 ,如:RunCASTEP.sh  name
结果发现同样不能计算pdos,和集群的情况一样!而采用网关的方法就可以。

发现这个问题后,想了很多办法都没有解决!希望那位大侠能够指导一二!

[ Last edited by gongjijun on 2010-7-18 at 22:01 ] 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • gongjijun

    顶上去,知道的朋友请指教一下呀!

  • zzy870720z

    没有提交过,知道一点
    你说的通过网关提交是指通过windows前台提交吧
    那样肯定是按你设置的计算
    但是在linux下用命令行提交作业,尤其要跑性质的话
    应该先计算结构优化,然后在提交性质计算吧,楼主是不是少了后面一步

  • cf666

    引用回帖:
    Originally posted by zzy870720z at 2010-07-14 08:31:12:
    没有提交过,知道一点
    你说的通过网关提交是指通过windows前台提交吧
    那样肯定是按你设置的计算
    但是在linux下用命令行提交作业,尤其要跑性质的话
    应该先计算结构优化,然后在提交性质计算吧,楼主是不是少了 ...

    优化后计算性质的PBS文件要怎么写? 望赐教!!!

  • gongjijun

    引用回帖:
    Originally posted by zzy870720z at 2010-07-14 08:31:12:
    没有提交过,知道一点
    你说的通过网关提交是指通过windows前台提交吧
    那样肯定是按你设置的计算
    但是在linux下用命令行提交作业,尤其要跑性质的话
    应该先计算结构优化,然后在提交性质计算吧,楼主是不是少了 ...

    谢谢。
    您说的很对,确实是这个样子的,我刚刚意识到了这一点,只是很奇怪,用pbs不能一次性提交吗?我想在pbs提交时能够一步到位,即优化后接着算出能带,dos不知道pbs文件怎么写才好

  • he23981006

    直接把要计算的性质添到你进行优化计算的脚本里就可以了啊。
    需要注意的是一定要把*.check文件拷贝成你要计算性质的check文件,如*—BandStr.check,对于DOS也是一样的。

  • zzy870720z

    引用回帖:
    Originally posted by gongjijun at 2010-07-14 21:38:01:



    谢谢。
    您说的很对,确实是这个样子的,我刚刚意识到了这一点,只是很奇怪,用pbs不能一次性提交吗?我想在pbs提交时能够一步到位,即优化后接着算出能带,dos不知道pbs文件怎么写才好?

    用脚本估计帮不上你,不是很熟
    应该可以的

  • crystal0714

    引用回帖:
    Originally posted by he23981006 at 2010-07-15 08:09:15:
    直接把要计算的性质添到你进行优化计算的脚本里就可以了啊。
    需要注意的是一定要把*.check文件拷贝成你要计算性质的check文件,如*—BandStr.check,对于DOS也是一样的。

    不会写脚本啊~~能给出具体的脚本命令行不?
    还有计算性质的时候需要的具体的文件类型有哪些呢?
    是不是优化完后的文件都是要的?

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