【求助】请求帮助：测得一个晶体数据有这么多错误！怎么办？
测得一个晶体数据有这么多错误：
8 个 A 1 个B 10个 C 5 个G
这样的数据还能不能发表？
怎么才能把8 个 A类错误解决。
Alert level A
SYMMG01_ALERT_1_A Unrecognised _symmetry_space_group_name_H-M
International Tables space group number is not in the CIF
From the CIF: _symmetry_space_group_name_H-M P(-1)
Int. Tables space group number for P(-1) is 0
SYMMG02_ALERT_1_A Supplied _symmetry_space_group_name_H-M not recognised
From the CIF: _symmetry_equiv_pos_as_xyz
x, y, z
-x, -y, -z
These symops generate the Hall space group symbol -p_1
which is equivalent to the H-M space group symbol p_-1
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D H1 .. H2B .. 1.36 Ang.
PLAT431_ALERT_2_A Short Inter HL..A Contact Cl1 .. O4 .. 2.32 Ang.
PLAT431_ALERT_2_A Short Inter HL..A Contact Cl1 .. O6 .. 2.46 Ang.
PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as . mixed
PLAT761_ALERT_1_A CIF Contains no X-H Bonds ...................... ?
PLAT762_ALERT_1_A CIF Contains no X-Y-H or H-Y-H Angles .......... ?
[ Last edited by 2274162 on 2010-8-16 at 16:10 ]
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问题不是很大的 有些不需要理会的
有些还是要修改一下cif文件的
首先你要确定下你的结构解析是不是已经是合理的，比如空间群是不是正确的，可以用platon检查下，还有就是所有指标是不是达到一般基本的要求了，比如漂移值是不是为0了，数据是否收敛，还有R1,WR2值等等参数，从你的错误看，好像是结构还没有解析清楚，这样check出来的结果是没有意义的
这些错误都可以解决，并且不难
第1和2 个问题 把_symmetry_space_group_name_H-M中的 P(-1) 改为 'P -1'
第3个问题 H2B上的氢加的不对，删除重新加氢
第4,5个问题没有关系，结构中本来就存在Cl .. O Short Inter Contact
第6个问题 把_refine_ls_hydrogen_treatment mixed 改为 constr
第7和8个问题 把ins文件中的 BOND 改为 BOND $H，再精修一次重新得到新的cif就解决了，
看你的a类错误觉得你解的差不多了 都是小问题
！