【求助】Gaussian优化结构，固定原子的坐标仍改变
构建Fe-zsm-5模型，在笛卡尔坐标下，所有的H以及与它直接相连的Si和O都固定，保证分子筛的定型，其余保持松弛。固定的方法是将文件中第二列0改为-1。但是进行结构优化后，固定原子的坐标也发生变化，请麻烦解答！
部分代码如下：
%chk=Fe3-zsm-5-5T.chk
%mem=512MW
%nprocshared=8
# opt freq b3lyp/genecp geom=connectivity SCF=NoVarAcc
Title Card Required
0 6
O -1 -4.39113332 2.60368738 3.55359680
O 0 -5.15455332 0.80555558 5.31199640
O -1 -6.91443732 2.46552138 4.28034940
O -1 -5.10231932 3.34386238 5.97435320
O -1 -2.41829532 2.55236858 7.64075880
O -1 -0.77694232 0.49764278 7.63944460
O 0 -5.79743332 0.56475198 7.84840240
O -1 -2.58102432 0.73844638 9.53714940
......
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京公网安备 11010802022153号
本人优化做的不多。
楼主这种情况应该看相对位置，而不是绝对位置。
高斯在做计算时，默认会将分子整体旋转平移到一个"比较好算"的位置，再进行计算，很多单点计算都可以看出计算后的位置和计算前的绝对位置（坐标）是不一样的，优化应该也是这种情况。
为了避免这种情况，楼主可以加入 nosymm 这个关键字，让高斯不进行位置变化操作，直接计算。
感谢建议！
我对比的是优化前后的Standard orientation，应该就是你所说的平移到比较好算的位置。还是说Standard orientation也会有变化，但是相对位置没有变？
是的。具体的你可以参考高斯手册中Symmetry的解释
http://gaussian.com/symmetry/
网上只找到16的，和09的是一样的
，
请问固定健长怎么设置的？