因为我所做的家族中含有20+的基因,想比较一下他们之间的相似度,如何操作呢?NCBI上的两两比对太慢,有没有那种类似于clustalw那种比对,一次性比对,出来一个数值化的结果。我是新人,不懂生物信息学,求高人告知,最好说的详细一点,非常感谢。ps.我没有多少金币,没法发求助帖。 返回小木虫查看更多
就用clustalw网页版的比对程序来做,会给你结果统计图,给你两两的相似度值,这个程序是EBI的,你可以clustal omega
这份需要建树,对比然后做一个evolutionary tree。看谁跟谁相近。我几年前做过,现在不知道什么软件最合适了。你查一下文献
您的这个问题解决了吗?能详细说一下如何得到多个蛋白序列的相似度?用clustalw网页版的比对程序如何做?两两的相似度值怎么得到?
就用clustalw网页版的比对程序来做,会给你结果统计图,给你两两的相似度值,这个程序是EBI的,你可以clustal omega
这份需要建树,对比然后做一个evolutionary tree。看谁跟谁相近。我几年前做过,现在不知道什么软件最合适了。你查一下文献
好的,非常感谢
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非常感谢。
您的这个问题解决了吗?能详细说一下如何得到多个蛋白序列的相似度?用clustalw网页版的比对程序如何做?两两的相似度值怎么得到?