各位好,我是生物菜鸟,前几天用CMD5单向引物得到了未纯化的pcr,送去生工测序,想问一下测序结果包括引物么?怎样去blast比对? 返回小木虫查看更多
测序结果一般是不会包括引物的,现在一代测序的基本原理就是Sanger测序——双脱氧末端终止法的原理,你的引物是一段连续的序列就没有终止一说了,所以是不会存在的。
测序从引物末端开始,但是开始的50 bp不准确,之后的800 bp的结果才可取
非常感谢
不纯化,会有之前pcr的引物污染。可能测不出来,看运气
测序结果一般是不会包括引物的,现在一代测序的基本原理就是Sanger测序——双脱氧末端终止法的原理,你的引物是一段连续的序列就没有终止一说了,所以是不会存在的。
至于怎么分析,你可以看看我以前的一个帖子,也是说这个的。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=10968470&authorid=1718048
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测序从引物末端开始,但是开始的50 bp不准确,之后的800 bp的结果才可取
非常感谢
不纯化,会有之前pcr的引物污染。可能测不出来,看运气