0 1
C -1.84006695 0.43903225 -0.86601440
H -1.00784863 0.10275058 -0.28358217
H -2.43449997 1.11157758 -0.28357800
H -2.43452475 -0.40162978 -1.15723128
C -1.32672473 1.16498852 -2.12341937
C -0.44153252 0.41404357 -3.13540575
H 0.44951770 0.07671059 -2.64843968
H -0.97715868 -0.42766937 -3.52208901
H -0.18192070 1.07132930 -3.93882169
O -1.62809665 2.36972168 -2.32679966,
我用RM06-2X/6-31G(d)对分子进行的结构优化,上图为输出文件给出的偶极矩方向。
下面是输入文件:
%nprocshared=16
%mem=5GB
%chk=acetone.chk
# opt rm062x/6-31g(d)
acetone
0 1
C -1.84006695 0.43903225 -0.86601440
H -1.00784863 0.10275058 -0.28358217
H -2.43449997 1.11157758 -0.28357800
H -2.43452475 -0.40162978 -1.15723128
C -1.32672473 1.16498852 -2.12341937
C -0.44153252 0.41404357 -3.13540575
H 0.44951770 0.07671059 -2.64843968
H -0.97715868 -0.42766937 -3.52208901
H -0.18192070 1.07132930 -3.93882169
O -1.62809665 2.36972168 -2.32679966,
化学家喜欢从正电中心指向负电中心。。物理学家喜欢从负电中心指向正电中心。。。没啥对错,看语境。。
这样子啊,那学化学的发表偶极矩计算的相关文章一般怎么处理呀?是应该用gaussian直接算出来的方向?还是按照化学的正电中心指向负电中心的方向?
刚看了一篇最近的angew(下图),这个偶极矩让我纠结了好几天。
未标题-9.png
当然是'负指向正了。
物理上偶极距定义的方向正好与化学上定义的方向是相反的,是由负指向正的!但看文献给的应该是化学方向!具体的我也不太清楚,因为我是学化生的,做有机的时候用Chem3D比较多顺便也用Gaussian,所以个人意见仅供参考,说错勿喷