请教串联质谱数据分析
本人微生物学专业,质谱小白,求大神赐教!!!
最近利用Agilent 6460 QQQ鉴定发酵液中脂肽类抗生素结构,看文献大多利用Data analysis 4.0 (Bruker Daltonics, Bremen Germany)来确定肽键断裂产生的b、y型离子,从而得到脂肽类物质结构。
但是我们这没有这个分析软件,想问问还有没有其他分析软件来确定b、y型离子或者结构?谢谢啦!!
附图是参考文献中的分析结果图
搜狗截图16年01月06日1526_1.png 返回小木虫查看更多
今日热帖
MaxQuant可以吧?还有Protein Prospector
谢谢!我试试,英语渣自学各种软件太困难了
请问一下有没有data analysis的安装包,能不能发我一下,谢谢
我可以使用Protein Prospector,帮你把蛋白分析出来,但我只会找到蛋白的分子量以及所带电荷,具体结构分析没做过
你有找到安装包吗
在没有软件的情况下,可以自己分析。
左边N端,右边C端。
由于蛋白质基本结构由肽键构成,肽键断裂的方式有ax、by、cz三种。by那里就是肽键。
所产生的碎片离子分别为a、b、c、x、y、z六种类型。含有 N terminal 碎片离子称为:a, b or c;含有C terminal的碎片离子称为: x, y or z.
比如你给的图,向左弯的是abc,向右弯的是xyz。肽键那里是b1y1 b2y2 b3y3,