【求助/交流】请问哪位虫子做过生物芯片方面的工作，有问题请教
我现在在做一个与生物芯片有关的工作。主要的目的是做成产品后，可以方便和快捷的鉴定和分析一个环境中（比如某一水域中）的微生物的多样性。我的做法是这样，先查找文献，找出文献中这个环境中已经筛选鉴定出的菌的名称，然后将这些菌的名称输入到NCBI中查找其核酸序列，主要是16SrRNA的全长序列。然后把这些菌和其所对应的序列交给专业公司，让其制作芯片。
现在有一个问题，什么样的序列是符合标准能够制作芯片的？
公司问我“每条序列对各自种属的代表性”这是什么意思？怎么查找其代表性？
本人不是做这个的，对于其中很多问题都不很明白，也搞不太懂，不知道我的问题问明白了没有。
请了解的给予帮助解答，谢谢啊。
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京公网安备 11010802022153号
楼主，我是想做免疫蛋白芯片的代理，也在对这方面做了解，楼主是否可以交流下
你好，我也想通过做生物芯片来鉴定新型纤维（如，牛奶、大豆蛋白纤维），我们可以交流一下吗？我是新手
如果要做微生物多样性，必然要做很多的探针来固定。这个代表性有可能是让你看看这些序列跟其他物种有多少相似性吧，是否由一条序列可以鉴定到属？或者就是到种？
16SrRNA基因的保守性又是相对的 ,在保守区之间存在着 9 个或 10 个变 异区(V1～V10) ,不同科、属、种间都有不同程度的差异。因此 , 将 16S rRNA 基因的保守 性和特异性结合起来用 ,是其在微生物分子诊断中的主要策略。公司所说的意思就是针对不同细菌序列制作相应互补探针。不过LZ你准备做多少个位点（即你准备检测多少种细菌，一种细菌得一条链），不知道楼主用的是哪家公司的基因芯片，上面做多可以有多少个结合位点。每条链都挺贵的（一个碱基大概1元左右，一条链一般是20-50个碱基，也即平均35元）。如果楼主是做筛查，芯片上的结合位点越多越好。以上都是在理想状态下，如果中途出问题，成本可能会更高，
这里生物芯片的topic太少了，大家应该更热心点去讨论。