diamond中同一原子重叠出现三次,怎样改成只出现一次 新手请教
原子位置没有设置好,LZ方便的话可以把原子位置参数贴上来。
Phase data Space-group P 63/m m c (194) - hexagonal Cell a=3.7780 Å c=8.8140 Å c/a=2.3330 V=108.95 Å3 Z=2 Atomic parameters Atom Ox. Wyck. Site S.O.F. x/a y/b z/c U [Å2] Y1 3 2a -3m. 0 0 0 B1 3 6h mm2 0.3333 0.23000 0.46000 1/4 O1 -2 6h mm2 0.3333 0.02400 0.04800 1/4 O2 -2 4f 3m. 1/3 2/3 0.11700,
楼主说的应该是下图中红圈的3个B原子,B的占位为1/3,所以3个位置中只能占据一个B,楼主把另外两个去掉就行了,可以看文献上是怎么画的。另外,O(1)实际上也是3个O在一起,但O(1)占位也是1/3,把另外两个去掉就行了。 如果从键长上看,B原子位置存在问题,B和O(1)之间距离比O离子半径还小。 [ Last edited by zbdfwq5777 on 2009-9-10 at 19:33 ]
我觉得可能在结构精修的时候原子种类定错了。看看cif文件里键长键角是不是合理
六方结构本来就是这样的,不过B1的温度因子太大,元素种类肯定是错了。 O1的另外二个不能去掉,因为要与O2构成正六面体的。 [ Last edited by monoclinic on 2009-9-10 at 22:02 ]
谢谢楼上的三位兄弟
在画Y的多面体图时,很明显O1三个叠加在一起了。 我对晶体解析不熟悉,所以难以理解怎料正确调整。再次感谢各位的参与。
原子位置没有设置好,LZ方便的话可以把原子位置参数贴上来。
Phase data
Space-group P 63/m m c (194) - hexagonal
Cell a=3.7780 Å c=8.8140 Å
c/a=2.3330
V=108.95 Å3 Z=2
Atomic parameters
Atom Ox. Wyck. Site S.O.F. x/a y/b z/c U [Å2]
Y1 3 2a -3m. 0 0 0
B1 3 6h mm2 0.3333 0.23000 0.46000 1/4
O1 -2 6h mm2 0.3333 0.02400 0.04800 1/4
O2 -2 4f 3m. 1/3 2/3 0.11700,
楼主说的应该是下图中红圈的3个B原子,B的占位为1/3,所以3个位置中只能占据一个B,楼主把另外两个去掉就行了,可以看文献上是怎么画的。另外,O(1)实际上也是3个O在一起,但O(1)占位也是1/3,把另外两个去掉就行了。
如果从键长上看,B原子位置存在问题,B和O(1)之间距离比O离子半径还小。
[ Last edited by zbdfwq5777 on 2009-9-10 at 19:33 ]
我觉得可能在结构精修的时候原子种类定错了。看看cif文件里键长键角是不是合理
六方结构本来就是这样的,不过B1的温度因子太大,元素种类肯定是错了。
O1的另外二个不能去掉,因为要与O2构成正六面体的。
[ Last edited by monoclinic on 2009-9-10 at 22:02 ]
谢谢楼上的三位兄弟
在画Y的多面体图时,很明显O1三个叠加在一起了。
我对晶体解析不熟悉,所以难以理解怎料正确调整。再次感谢各位的参与。