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作者
最后发表
分子模拟
分子动力学模拟及其LAMMPS实现
建模和
后处理
软件概述6.出错解决思路7.专题一:纳米流动(部分内容)8.专题二:纳米流体(待更新)9.专题三:润湿(部分内容)9.1建模10.专题...这是因为在绝大多数模拟中采用的是笛卡尔
坐标
。...
luyaobao
2022-05-22 06:58
硕博家园
[悬赏]
xyz型原子坐标文件的后处理
具体内容请详见'http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=11783841&pid=1#pid1'博士多年了,实在来不及了,请大家有能力的帮帮忙帮帮忙您的帮助可能对我是一生的影响,谢谢
wangwy13
2017-11-01 04:05
分子模拟
[悬赏]
xyz型原子坐标文件的后处理
详见'http://muchong.com/t-11783841-1'
wangwy13
2017-11-01 02:55
第一性原理
[悬赏]
xyz型原子坐标文件的后处理
需要进行
的后处理
过程:0.输出的坐标中都是置换
型
溶质原子的坐标,在进行以下计算时,需要您将溶剂原子的坐标,按bcc晶体的对称性补上(模拟盒子的总大小和原点是知道的,因此所有
原子坐标
...
wangwy13
2017-11-01 02:56
量子化学
大体系弱相互作用计算的解决之道
XYZ
坐标后面的0代表这个
原子坐标
不做优化,如果所有坐标后面都是0就代表这是个单点任务,如果有的坐标后面是1,就代表当前任务是...water.
xyz
是体系结构的
xyz文件
,-level后面接理论方法和基组...
sobereva
2013-12-17 07:41
分子生物
生物学软件大汇总!史上最全
对蛋白进行有关的多肽酶
处理后
产生...当程序不能辨别序列的格式时(通过寻找常用序列格式的特征),会显示这个
文件的
文本形式,以便你编辑生成正确的蛋白质或DNA序列,编辑
后
可以再被载入程序...
小木虫刘树青
2013-05-17 04:49
量子化学
Multiwfn 3.0波函数分析程序的意义、功能与用途
可执行
文件的
压缩包很小巧,仅不到5MB,下载、传播都很便利。Windows版Multiwfn支持从WinXP到Win8的各个版本,32/64bit系统皆可兼容。程序不需要安装,...载入含有分子
坐标
的文件(pdb、
xyz
等...
sobereva
2013-04-29 03:41
量子化学
使用Multiwfn绘制
原子
轨道图形、研究
原子
壳层结构及相对论效应的...
比s角动量更高的原子轨道有的角度部分是复数,复数
型原子
轨道难以图形表示,用起来也不方便,因此一般都是将复数
型原子
轨道线性组合成实数型...选-5从刚才
的后处理
界面退回到主界面,依次输入...
sobereva
2012-07-08 06:16
量子化学
【sobereva个人文集】首个完全基于GPU的量化软件-TeraChem杂谈及...
输入
文件的
编写比较容易,比如一般的计算任务(这里是结构优化)只需要如下这么写,含义不言自明,前后顺序随意。...NEB方法必须提供过渡态前后两个位置的初猜
坐标
(这一点类似于QST2),这...
sobereva
2012-04-30 02:57
量子化学
用Multiwfn、Gaussview、Molekel、VMD观看龙虾、盆景、骨盆、...
从Multiwfn2.3开始,Multiwfn可以读入cube文件,可以直接用于显示cube
文件的
等值面。...从raw转换为cube文件时为了兼容性考虑,会自动在原点加入一个氢
原子
,因此会有一个氢
原子
标签,可以点...
sobereva
2012-02-22 06:45
分子模拟
【原创】LAMMPS手册中译版学习,Lammps_安装步骤详解,LAMMPS版本...
原子坐标
,速度和其它原子量信息的文本dump
文件
二进制重启...每个原子的时间与空间平均系统宽量的时间平均原子图像,
XYZ
,XTC,DCD,CFG格式数据的前处理与
后处理
:包里提供了一系列的前...
御剑江湖
2011-03-24 02:31