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最后发表
计算模拟
如何使用高斯
ONIOM
模型中mechanical embedding方法
【
求助
】
ONIOM
的mechanicalembedding方法
Gaussian
的
ONIOM
模型对MOF材料QM/MM计算,考虑MM对QM电荷嵌入的时候,有mechanicalembedding(法一)和electronicembedding(法二)两种方法。...
脉脉如烟
2018-04-30 02:58
量子化学
【
求助
】G09分层优化报错 Berny optimization
Gaussian
的输入文件为:%chk=Fe-ZSM-5-12T.chk%mem=512MW%nprocshared=8#optfreq
oniom
(m06l/6-31+g(d,p):uff)geom=connectivityTitleCardRequired020202O-O_2-10.556067758....
youfish
2017-06-02 04:53
计算模拟
请各位帮忙,关于
ONIOM
计算中泛函的问题
求助
:我用
Gaussian
09D.01版本
ONIOM
方法计算模型,输入命令如下:#opt
oniom
(ωB97XD/6-31G*:uff)nosymmiop(5/13=1,1/61=2)在终端无法提交.gjf文件,显示该命令行语法错误,希望得到各位...
博雅LMZ
2017-03-30 01:59
量子化学
【
求助
】
Gaussian
错误
求助
:One-electron integrals.Zero scale ...
描述:用
oniom
计算AT碱基对与镉离子,分三层。错误信息:One-electronintegralscomputedusingPRISM.ZeroscalefactorinPutShl.ErrorterminationviaLnk1einvol-th/home/bosong/g...
hp以火之名
2016-11-28 01:25
量子化学
求助
讨论:
Gaussian
中的
ONIOM
方法中的截断问题
我想使用
Gaussian
软件中的
oniom
算法计算蛋白-配体间相互作用。看到很多文献里面有相关的计算。我尝试过几种方法,但都失败了。想请教一下各位:如何才能正确地对蛋白配体进行分层截断。谢谢...
thanks523
2016-07-06 12:50
量子化学
gaussian
oniom
计算时原子的原子类别和电荷参数该怎么添加
向各位大神
求助
!我计算的体系是DNA和小分子配体,把DNA设置为低层并用amber方法计算,那该怎样添加这些原子的原子类别和电荷参数?
dkgmx
2015-03-27 08:20
量子化学
关于反应机理计算的问题集锦+
求助
【答】
gaussian
【问】如何计算?【答】一种是你自己设计过度态,然后优化过度态,或者用QST2或者QST3方法寻找过度态,完了做频率分析,然后做IRC,然后计算单点...
Oniom
方法可用来研究比较大的体系
gebitingqin
2011-10-15 03:09
分子模拟
求助
各位,关于初学分子模拟
现在需要研究蛋白质与小分子比如金属配合物等的相互作用,想
求助
一下各位,关于这个方向,哪些软件可以使用,各有什么特点...
oniom
是否也能起到qm/mm的作用,是否有用
gaussian
研究大分子的呢?...
hexinchem
2011-04-29 04:45
量子化学
【
求助
】结构优化报错,
一直都是用ms做,现在做
oniom
,用到
gaussian
,但在gaussview里面构造好构型,但是提交到
gaussian
中,一直报错报错:TrustRadius=3.00D-01FncErr=1.00D-07GrdErr=1.00D-07Numberof...
charityqi
2011-04-15 01:24
量子化学
【
求助
】报错 open of exec.fil failed.怎么解决
怎么解决
Gaussian
03版系统是WINDOWS输入文件:%CHK=parimary1
ONIOM
.CHK#
ONIOM
(B3LYP/6-31G(d)M3)OPTTESTprimary
ONIOM
010101C03.0595455.1624930.680684LC0-2....
cz020510210
2010-12-21 09:09
量子化学
【
求助
】
ONIOM
的一个细节问题
在使用
Gaussian
View设置
ONIOM
计算时,点选multilayer
ONIOM
medel进到设置界面,在Lowlayer有个选择项useelectronicembedding,请问这个选项是什么意思,有什么作用?多谢高手指教。
sunzhiguo
2010-12-02 12:43
量子化学
【
求助
】重金求专家解决:如何给过渡金属加半经验参数?
ProceedbyaFacileStepwiseMechanismFTand
ONIOM
(DFTM3)Studies他是这样做到的:The
ONIOM
...versionof
Gaussian
98developedbyuswhichincorporatesthesemiempirical...
x7511413
2010-09-06 11:08
量子化学
【
求助
】使用
gaussian
的
oniom
+amber的时候出现错误
大家好,我使用
Oniom
分层计算,具体的参数是:#
ONIOM
=(RHF/6-31G:AM1:Amber)但是出现如下错误:IncludeallMM...是不是要用特殊的链接,使得
gaussian
计算的时候,也可以计算amber?...
javacfish
2010-06-20 09:29
量子化学
【
求助
】软件构模问题
我想用
Gaussian
中的
ONIOM
方法计算比较大的分子,如肽、蛋白质等,但是不知道用什么软件构建分子构形,发现用GaussView挺麻烦的,请高手推荐几款构建大分子的图形软件。非常感谢!
lmzhao
2010-05-12 02:00
量子化学
【
求助
】如何用
oniom
方法做单点
我想在
gaussian
中用
oniom
方法算分子(SnH3CH3)的单点能。(PS:体系分两层:高层用CCSD,但高层中不同原子用的基组不一样(Sn的基组用def2-tzvp基组,还有赝势,H用6-31g*);低层用B3LYP,...
chemlilyzhao
2010-05-10 01:35
量子化学
【
求助
】
GAUSSIAN
ONIOM
算 NMR
匿名
2009-10-24 01:36
第一性原理
【
求助
】
gaussian
怎样设置
oniom
我想计算一下表面活性剂在水上的性质,怎样才能得到几十上百个水分子以及表面活性剂分子的输入?...如果有这方面的例子,或是
oniom
的其他例子,请上传个输入输出文件,金币相谢。
li_hx2001
2009-09-25 01:30
量子化学
【
求助
】
gaussian
中
oniom
如何设置
匿名
2009-09-16 09:58
量子化学
【求助】
gaussian
ONIOM
求助
匿名
2009-09-09 04:06
量子化学
【
求助
】Problem with the distance matrix
我在用
oniom
优化一个分子筛晶体结构的时候,计算终止并提示Problemwiththedistancematrix.有一部分原子时固定的,结构我是从CIF文件转化来...下面是输入的文件:%chk=G:\
gaussian
inand...
longyun80
2009-06-30 01:42
量子化学
【
求助
】
gaussian
中的
oniom
匿名
2009-04-17 02:11
量子化学
【
求助
】
gaussian
中关于
oniom
(b3lyp/6-31g:am1 or uff)
匿名
2008-03-26 08:35