小木虫论坛-学术科研互动平台

版块导航: 正在加载中...

登录注册

显示全部

分类	共搜索到 90 个相关话题(最多显示前5000个)	作者	最后发表

分子模拟	蛋白质同源建模，模板序列比目的序列短，构建出的模型缺失三十个... 模板和目的序列同源性有50.3%，一致性有62.5%，但是按照DS操作流程建模后，模型缺失了前面没有比对上的三十个氨基酸，这种情况应该怎么办呀，是否可以把前面的三十个氨基酸单独建模后与后面...	草莓圣代_	2023-03-06 05:42
药学	DS同源建模在DS中打开fasta格式的蛋白序列，然后执行Protocol-SequenceAnalysis-BLASTSearch（DSServer），选择InputDatabase为PDB_nr95,然后运行，可最后生成了一个Error.txt文件有大佬知道这是为...	橘子桔子橘	2022-05-21 09:45
分子模拟	分子对接DS/SybylAutodock教程展示原子间距离同源建模同源建模原理介绍1同源建模的功能及使用场景2同源建模的方法2.同源蛋白的搜索2.1UNIPROT数据库介绍2.2Proteindatabank数据库介绍2.3搜索同源蛋白——blastp2.4蛋白...	gunmde	2021-08-28 10:47
分子模拟	分子对接DS/SybylAutodock教程培训展示原子间距离同源建模同源建模原理介绍1同源建模的功能及使用场景2同源建模的方法2.同源蛋白的搜索2.1UNIPROT数据库介绍2.2Proteindatabank数据库介绍2.3搜索同源蛋白——blastp2.4蛋白...	gunmde	2021-08-28 09:28
药学	最优AIDD与CADD计算机辅助药物设计培训，线上实操有回放！ AI人工智能药物设计药物发现：常见药物设计软件（Autodockvina,DS,薛定谔,分子指纹介绍与安装）分子动力学Amber软件Python基础与进阶modeller同源建模机器学习方法预测临床前潜在有效的药物...	黄昏下a	2021-08-28 06:14
分子模拟	分子动力学-同源建模-分子对接-计算机辅助药物设计分子动力学现场或视频实操演示五、Python基础与进阶、Pythonpandas,numpy案例介绍与应用、可视化分析系列六Pymol蛋白结构软件——从安装到精通七、同源建模原理介绍1.同源建模的功能及使用...	kongyaping	2021-08-24 05:56
分子模拟	寻蛋白质分子对接和分子动力学模拟有偿教学（DS，YASARA等）急寻高手教学有偿教学，同源建模、分子对接和分子动力学模拟。有意者加QQ1633403467详聊，加QQ时请注明“分子模拟教学”。hand:	xuyisit	2021-08-09 02:15
招聘信息布告栏	招聘分子动力学Gromas/Amber-量化计算QMMMMD-材料模拟等本硕博... 相关领域：1：生物大分子结构：同源建模Modeller，Swiss-model，I-TASSER,Rosetta等2：分子对接领域：Autodock/Vina，ZDOCK/Rosetta/HEX，DS，GOLD，MOE等软件，包括柔性对接，共价对接，...	uprp9342	2021-02-07 12:21
分子模拟	分子模拟计算招聘，分子动力学计算招聘本硕博兼职相关领域：1：生物大分子结构：同源建模Modeller，Swiss-model，I-TASSER,Rosetta等2：分子对接领域：Autodock/Vina，ZDOCK/Rosetta/HEX，DS，GOLD，MOE等软件，包括柔性对接，共价对接等3...	uprp9342	2021-02-03 12:51
分子模拟	DS软件分子对接大家好，我想问下同源建模出来的结构与配体不在CDR区对接上，而在其他非CDR空腔对接上了，请问这是什么原因呢？同源建模出来的结构也是DS软件建出来的，建出来的模型各项评分都达到标准	masochism	2020-11-02 03:41
分子生物	药物分子设计学习混合体系、石墨烯、纳米管模拟计算4、伞形采样——计算结合自由能5、药物分子开发溶剂筛选6、固/晶体建模仿真、结构变化分析7、...蛋白相互作用（ZDOCK或DS中的ZDOCK模块）8、构效关系分析3D-...	互动派赵	2020-07-13 03:17
分子模拟	DS 软件使用疑问，请大神们指点一二大家好，在使用DS软件做同源建模的时候，在loadstructure时，会跳出一个无法下载的对话框，具体如下图。其实我是可以找到要做为template的pdb，但是不知道如何上传到软件的本地位置文件夹...	dhmdddd	2020-04-14 02:17
招聘信息布告栏	计算模拟兼职相关领域：1：生物大分子结构：同源建模modeller，rosetta，swiss-model等，包括同源/异源多聚体，包含金属离子/hem/fad等建模2：分子对接领域：autodock/vina，zdock/rosetta/hex，ds，...	hazheng	2020-01-03 04:57
分子模拟	YASARA分子模拟综合软件，秒杀DS、SYBYL、Schrodinger 打开16万原子的体系仅需2s，秒杀DS、sybyl以及Schrodinger2...交互式构建多糖结构，每一步进行能量最小化功能介绍——YASARAStructure在Dynamics的基础上增加了分子对接和同源建模（WHATIF）1....	沙漠猎人	2019-10-25 09:20
招聘信息布告栏	招聘分子模拟兼职学生-分子对接/同源建模/虚拟筛选/分子动力学等相关领域：1：生物大分子结构：同源建模modeller，rosetta，swiss-model等，包括同源/异源多聚体，包含金属离子/hem/fad等建模2：分子对接领域：autodock/vina，zdock/rosetta/hex，ds，...	longytu	2019-06-19 12:09
硕博家园	招聘分子模拟兼职学生-分子对接autodock/虚拟筛选/分子动力学... 相关领域：1：生物大分子结构：同源建模Modeller，Swiss-model等2：分子对接领域：Autodock/Vina，ZDOCK/Rosetta/HEX，DS，GOLD，MOE等软件，包括柔性对接，共价对接等3：分子动力学：...	dingo226	2019-06-16 04:19
分子模拟	DS2.5同源建模用DS2.5根据教程练习同源建模，sequenceanalysis中找到了和p41131的相似度最好的4个同源序列，结果在加载这四个序列结构时运行不了，有了解的大佬能帮我分析一下什么原因吗smutaooxox6085	suliqiang	2019-05-15 11:42
分子模拟	DS同源建模不能load模板结构 DS2.5同源建模时，在BLAST同源序列后，需要选择序列然后LoadSelectedStructures，为什么我的总是显示Unable，不知道是还需要打开那个文件吗？为什么总是问“Unabletoloadafileatthistime-...	himoli	2018-11-22 05:08
计算模拟	DS2.5软件学习新手小白，最近刚学discoverystudio2.5要做蛋白同源建模和分子模拟，求找能带我入门的或者一起学习的同伴	偷腥的黑猫	2018-09-11 09:40
分子模拟	ds同源建模后用pymol分析b-factor的问题我用ds对一个蛋白进行单点突变的同源建模，然后用pymol对其进行b-factor分析（catroonputty），但是发现突变前后蛋白并没有什么变化（红色部分的结构没什么变化），尝试了好多个点的突变...	飘逸的云	2018-08-13 12:03